氢气压缩机及其辅佐体系的保护措施首要包括：设备地点的区域属于含氢区域，所用电气设备和仪器的防爆等级应与此兼容。循环氢气压缩机的轴端密封件是运行的要害，也是一个常常产生机械故障的地方。面部密封件的挑选应合适其工作条件。关于进口压力高于12.0MPa的压缩机，应先挑选油膜密封；在进气压力为12.0MPa以下时，可根据实际情况运用干气密封。入口压力低于8.0MPa时可以考虑运用机械密封。

　　正确挑选压缩机的辅佐体系，如人口过滤器，级间气液别离罐，级间冷却器，进出口缓冲罐，光滑和冷却体系等，以保证正常出产的操作。在方案阶段，往复式压缩机须对管道体系的管道感觉进行模拟分析，以挑选合适的缓冲罐，孔板管道长度以及体系中的重要组件，例如冷却器和别离器。光滑油体系的主油泵须配备一个泵，而且原动机应由一蒸汽和一电动来驱动。蒸汽泵正常运行，电动泵是备用的。密封油高位油箱的液位高度操控密封油的压力。

　　设备的高度应由制造商的规矩确定。在设备规划和保护期间，不能随意更改。低压光滑油停机联锁应设置为两个。高液位罐，油气别离器和脱气罐的低液位警报和低液位停机应具有自己的液位开关。防喘振操控设置为通过自动操控将一部分气体从出口返回到进气，以保证进气流量大于喘振值。氢气压缩机的常见技术问题如下：气体带着固体颗粒，导致滤网堵塞，而且气阀和气缸套损坏。介质带着液体，这会影响气缸的光滑，甚至会损坏气阀或产生液体撞击事故。